每年，由于细菌感染，单单在美国就有超过万例败血症。一百万以上的病例中有超过四分之一是致命的。
现在，一个新的强大的诊断系统可以从根本上改善这些统计数字，与第一种测试，可以同时筛选了所有已知的人类病原菌–同时确定引起抗生素抗性的基因。
这个平台，被称为baccapseq，是由哥伦比亚大学的研究人员设计的，他们说它有明显的加速致命细菌感染的诊断潜力，最终每年帮助拯救了成千上万人的生命。
“一旦批准临床使用，baccapseq会给医生一个强大的工具，快速、准确地筛选所有已知的致病细菌，包括那些引起败血症死亡的第三大原因。这个平台比传统的无偏测试灵敏倍，相当于一次筛选一种细菌的测试。
目前，最常见的脓*症诊断形式是在培养中培养细菌，如果不再培养难以培养的物种，通常需要两到几天才能完成。
目前，BacCapSeq在70个小时内交付结果——这个时间框架并不总是很快——但是研究人员说，随着计算能力的预期提高，这种滞后将会减少。然而，在这种情况发生之前，该系统还有其他优点需要考虑。
BacCapSeq遵循一个类似的工具来治疗所有已知的病*感染，称为VirCapSeq-VERT，它是由一些相同的研究人员在年开发的。
虽然VirCapSeq-VERT可以鉴定已知感染脊椎动物的个病*分类群，但BacCapSeq更进一步，能够检测种已知致病菌的特征DNA，同时评估它们的*性和抗菌性。
考虑到下一个最先进的病原体鉴定工具——多重聚合酶链反应（PCR）系统——只能筛选最多19种病原菌，这是一个巨大的飞跃，对那些健康人来说是一个范式的转变。
“微生物智能必须是精密医学不可或缺的组成部分，”CII主任、高级研究员W.IanLipkin说。对传染病进行准确、早期的鉴别诊断，了解药物敏感性概况，可以减少死亡率、发病率和医疗费用。
BacCapSeq使用万个称为寡核苷酸的分子作为基因探针，通过与潜伏在血液样品中的细菌的DNA序列结合。同样的技巧不只是检测细菌，而且是已知抗菌基因的任何标志物。
为了测试这个诊断工具，研究小组在血液样本上运行它，这些血液样本带有诸如大肠杆菌、脑膜炎奈瑟菌、肠炎沙门氏菌等多种细菌有效载荷，在每种情况下，该平台的敏感性都优于常规病原体测试，例如，RA高通量筛选。
研究人员承认新系统的一些局限性。因为该试验是定性的，而不是定量的，在细菌鉴定方面，它不能取代PCR分析，在知道细菌数量很重要的情况下。
此外，这和我们对现有病原体的遗传知识一样好——一种与已知病原体相差超过40%的编码序列的新型细菌将无法被检测。所以，还有改进的余地，而BacCapSeq的团队也没有放松改进。
在已经改变了细菌和病*诊断的未来前景之后，研究者们现在正在研究第三个系统——一个可以对真菌感染做同样事情的系统。